בדיקת חניכיים כוללת בירור המצב הרפואי הכללי, בדיקה קלינית בחלל הפה וניתוח צילומי הרנטגן (סטטוס/פנורמי). הבדיקה מתבצעת על ידי פריודונט - רופא שיניים מומחה למחלות חניכיים. סימני המחלה המביאים אדם להיבדק הם נפיחות בחניכיים, דימום , ריח פה, פתיחת מרווחים בין השיניים, ניידות שיניים ואובדן שיניים. גורמי הסיכון המחמירים מחלת חניכיים הם עישון, מצבים בריאותיים מסויימים כגון לחץ נפשי, סכרת, הריון ושימוש בתרופות מסויימות. בבדיקה הקלינית מתרשמים ממראה החניכיים, כמות האבנית, מודדים את עומק הכיסים סביב השיניים ומתעדים את מדד הרובד (מתעד את הגיינת הפה), מדד הדימום ומידת ניידות השיניים. בבדיקה הרנטגנית בודקים את מידת אובדן העצם התומכת בשיניים. רופא החניכיים גם מצביע על גורמים מקומיים כגון סתימות וכתרים לקויים הגורמים לצבירת רובד ומחמירים מחלת  חניכיים. לאחר הבדיקה נקבעת תכנית טיפול ראשונית הכוללת הדרכת המתרפא לבקרת רובד, הסרת אבנית, הקצעת שרשים וטיפול בגורמים המקומיים. כעבור כחודשיים מתבצעת הערכה מחדש של מצב החניכיים ונקבעת תכנית טיפול משלימה שעשויה לכלול ניתוחי חניכיים ו/או תכנית תחזוקה.